Dr. Melih Aygün, Orta öğretimini 1983 yılında F.M.V. Özel Işık Lisesinde tamamladı. 1989 yılında Trakya Üniversitesi Tıp Fakültesinden mezun olan Dr. Aygün, 1996 yılında Zeynep Kamil Çocuk ve Kadın Hastanesinde Kadın Hastalıkları ve Doğum Uzmanı oldu. İhtisas sonrası 1997-1998 yıllarında fellow olarak Viyana Üniversitesi Tıp Fakültesi Reprodüktif Endokrinoloji ve İnfertilite bölümünde Yardımcı Üreme Teknikleri tanı ve tedavileri ve Reprodüktif Endokrinoloji üzerine çalıştı.
1999 yılında Alman Hastanesinde ve 2000-2004 yıllarında Memorial Şişli Hastanesi Yardımcı Üreme teknikleri ve Genetik bölümünde çalıştı. Dr. Aygün; İstanbul Tabib Odası, ESHRE (Avrupa İnsan Üreme ve Embriyoloji Birliği), ASRM (Amerikan Üreme Tıbbı Birliği) üyesidir. İngilizce ve Almanca bilen Dr. Aygün'ün ulusal ve enternasyonal bilimsel toplantılarda 25 sunumu vardır.
